中心现有研究团队2个，包括天然产物化学成分研究与利用项目组、植物次生代谢生物工程研究项目组，设有天然产物提取和分离技术实验室、药用植物分子生物学实验室、天然产物活性筛选实验室、化学分析测试实验室、中试实验室等多个具有独立科研能力，又相互配合的功能实验室。2018年在岗科研人员23人，其中高级职称11人、中级职称12人。在读硕、博士研究生14人。
以我国丰富的植物资源为研究对象，开展活性天然产物的结构测定、生物活性与功能、结构修饰与合成、分布及演化规律、代谢合成及调控的研究。开发安全、有效、质量可控、成分清楚和作用机制明确的新药、功能性食品和生物农药等产品。为我国天然产物资源的合理开发与持续利用，以及创新天然药物（农药）和中药现代化的发展做出贡献。
副主任（主持工作）：单 宇 电话：025-84347159
副主任： 李晓丹 电话：025-84347068
开展天然产物活性成分分离、纯化及结构鉴定、先导化合物优化及生物活性研究，并按国家新药评审要求开展临床前研究工作
开展新型药物筛选模型、靶点的发现与研究以及活性成分筛选体系的建立；对癌症、糖尿病、早老性痴呆等疑难病症进行药用植物的定向药效筛选；发掘国内紧缺、珍稀濒危药用植物的替代资源；从植物、微生物中进行生物活性物质的筛选工作；筛选和发掘新的高效、低毒生物农药
选育优良抗逆、高含量（活性成分）药用植物新品种，构建基因操作技术平台，发掘和利用其功能基因。重点研究药用植物重要活性成分在生物代谢过程中关键合成酶的基因，包括：药用植物重要活性成分关键合成酶的基因克隆，功能分析，分子修饰及转基因研究。最终对关键合成酶进行修饰表达以提高植物重要活性成分含量。
对于体内生物合成代谢途径比较清楚，对目前社会影响较大的疾病具有高效治疗效果或具有其他重要应用价值的天然化学产物成分，克隆该生物合成途径中的基因，构建该成分的高效表达菌株，利用基因工程菌株直接高效生产该重要活性成分，降低其生产成本，应用于工业化生产
