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  鸭儿芹属(Cryptotaenia)在全球有56种。中国有鸭儿芹(C. japonica Hasskarl)一种,广泛分布于中国、日本和朝鲜半岛,其叶和花序类型在分布区内展示了几乎连续的变化,存在以下三种变型鸭儿芹(原变型)C. japonica f. japonica、 深裂鸭儿芹C. japonica f. dissecta (Y. Yabe) Hara和 羽裂鸭儿芹C. japonica f. pinnatisecta S. L. Liou,且与分布于北美的北美鸭儿芹(C. canadensis (Linnaeus) de Candolle)为东亚-北美间断分布的“姐妹种”。对东亚广泛分布的鸭儿芹进行了广泛的取样并进行标本研究和简化基因组研究。研究共得到539946个未连锁的高质量SNP,平均πHOHEFIS值分别为0.0620.0660.043-0.014;种群分化不受距离隔离的影响;确定了与地理位置相对应并表现出不同水平遗传多样性的六个主要不同区域;成对FST分析显示,在连续Bonferroni校正后,六个地区0%-14%的居群存在显著的群体分化(P<0.05);三次历史基因流表明了东西方向性。此外,使用Jost’s DNei’s GSTNm值进行的当代基因流分析强调了东亚中纬度地区是鸭儿芹遗传结构的重要贡献者。我们的研究阐明了东亚地区鸭儿芹相对较低的遗传分化和种群结构,进一步加深了我们对中-日植物区系多样性的理解。

  研究成果以“Genetic diversity, population structure, and phylogenetic relationships of a widespread East Asia herb, Cryptotaenia japonica Hassk. (Apiaceae) based on genomic SNP data generated by dd-RAD sequencing”为题发表于国际著名植物学杂志Frontiers in Genetics。植物分类与保护项目组吴宝成副研究员为该论文第一作者和通讯作者。该研究成果得到了国家自然科学基金青年基金项目(31300166)的资助。

  论文链接:https://doi.org/10.3389/fgene.2024.1368760

1 鸭儿芹的生境、植株、果实和不同变型叶片照片

2 鸭儿芹居群取样点分布

3 基于Jost’s D 、Nei’s GSTNm 的基因流